ELISA酶聯免疫吸附試驗的標準程序，通常是把蛋白、抗體、或激素等（即抗原）直接或是以捕捉抗體（capture Ab）固定在固相載體上，再加入一級檢測抗體（primarydetection Ab），形成一個抗原抗體的復合物。如果該抗體已經用酶（enzyme）標記了，即可用來直接測定抗原的量，若無，則可利用另一個酶標記的二級抗體來測定抗原的量。測定抗原量的方法是加入該酶的底質（substrate），作用后產生出現的顏色深淺和樣本中的抗原量呈正比的關系，依此原理計算出樣本中的抗原總量或濃度。

1.直接法（direct ELISA）

將抗原直接固定在固相載體上，加入酶標記的一級抗體，即可測定抗原總量，此一級抗體的特異性非常重要。

優勢：操作手續簡短，因無須使用二抗可避免交互反應。

缺點：試驗中的一抗都得用酶標記，但不是每種抗體都適合做標記，費用相對提高。 

2.間接法（indirect ELISA）

此測定方法與直接法類似，差別在于一級抗體沒有酶標記，改用酶標記的二級抗體去辨識一級抗體來測定抗原量。

優勢：二抗可以加強信號，而且有多種選擇能做不同的測定分析。不加酶標記的一級抗體則能保留它多的免疫反應性。

缺點：交互反應發生的機率較高。 

3.雙抗體夾心法（sandwich ELISA）

被檢測的抗原包被在兩個抗體之間，其中一個抗體將抗原固定于固相載體上，即捕捉抗體。另一個則是檢測抗體，此抗體可用酶標記后直接測定抗原的量；或不標記，再透過酶標記的二級抗體來測定抗原的量。這兩種抗體必須小心選取，才可避免交互反應或競爭相同的抗原結合部位。

優勢：高靈敏、高專一性，抗原無須事先純化。

缺點：抗原一定得擁有兩個以上的抗體結合部位。

4.競爭法（competitive ELISA）

樣本里的抗原（自由抗原）和純化并固定在固相載體上的抗原（固定抗原）一起競爭相同的抗體，當樣品里的自由抗原越多，就可以結合越多的抗體，而固定抗原就只能結合到較少的抗體，反之亦然。經清洗步驟，洗去自由抗原和抗體的復合物，只留下固定抗原和抗體的復合物，拿來與只有固定抗原的對照組結果相比較，根據呈色差異就可計算出樣品里的抗原含量。

優勢：可適用比較不純的樣本，而且數據再現性很高。

缺點：整體的敏感性和專一性都較差。